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【NGS技術(shù)??诹?| 儀器設(shè)備】揭秘基因測(cè)序核心“武器”
來(lái)源: | 作者:沃小森 | 發(fā)布時(shí)間: 2025-02-25 | 78 次瀏覽 | 分享到:

下一代測(cè)序技術(shù)(NGS)的快速發(fā)展,讓精準(zhǔn)醫(yī)療、生命科學(xué)研究邁入全新維度。而在這背后,離不開(kāi)實(shí)驗(yàn)室里那些“低調(diào)的硬核設(shè)備”。本期??覀儗哌M(jìn)NGS實(shí)驗(yàn)全流程,揭開(kāi)核心儀器設(shè)備的神秘面紗——它們?nèi)绾螀f(xié)同作戰(zhàn),將樣本轉(zhuǎn)化為海量基因數(shù)據(jù)?

NGS實(shí)驗(yàn)流程

01、樣品制備及提取

02、樣品質(zhì)檢

03、文庫(kù)構(gòu)建

04、文庫(kù)質(zhì)檢定量

05、測(cè)序及驗(yàn)證

01樣本制備提?。壕珳?zhǔn)的“起跑線”

組織研磨/均質(zhì)儀

充分研磨樣品,應(yīng)用于對(duì)生物樣品的DNA提取實(shí)驗(yàn)分析,確保樣品前處理的理想效果;



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核酸提取儀

高效提取DNA/RNA,確保樣本純度與完整性。

關(guān)鍵指標(biāo):通量(單批次處理樣本數(shù))、兼容性(血液、組織、FFPE等樣本類型)



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02文庫(kù)構(gòu)建:從“原料”到“標(biāo)準(zhǔn)化產(chǎn)品”

片段化設(shè)備—超聲破碎儀

聲波能量將DNA剪切至特定長(zhǎng)度。



非接觸式超聲波破碎儀品牌:Diagenode高通量聲波基因組剪切儀品牌:凈信




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真空離心濃縮儀

高效去除樣品中的溶劑,同時(shí)保護(hù)樣品的生物活性和化學(xué)結(jié)構(gòu),確保文庫(kù)構(gòu)建的質(zhì)量和效率。


離心真空濃縮儀品牌:富睿捷



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自動(dòng)化建庫(kù)工作站

優(yōu)勢(shì):減少人為誤差,實(shí)現(xiàn)末端修復(fù)、加接頭、PCR擴(kuò)增等步驟的全流程自動(dòng)化。

適用場(chǎng)景:大規(guī)模臨床檢測(cè)或高通量研究項(xiàng)目。


全自動(dòng)基因測(cè)序文庫(kù)制備儀UNIPre-1品牌:銘毅智造



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PCR儀

核心任務(wù):擴(kuò)增文庫(kù),增加測(cè)序信號(hào)強(qiáng)度。

選擇要點(diǎn):溫控精度、升降溫速度(影響擴(kuò)增效率)。



ProFlex PCR System PCR儀品牌:ThermoFisherRePure-T智能梯度PCR儀(三槽)品牌:柏恒




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03測(cè)序儀:數(shù)據(jù)生產(chǎn)的“超級(jí)引擎”

主流測(cè)序平臺(tái)

Illumina :通量王者,單次運(yùn)行可產(chǎn)出6Tb數(shù)據(jù),適合全基因組測(cè)序或大規(guī)模隊(duì)列研究。

MGI :國(guó)產(chǎn)標(biāo)桿,超高通量+低成本,強(qiáng)勢(shì)進(jìn)軍臨床市場(chǎng)。



NovaSeq 6000基因測(cè)序儀品牌:illuminaMGISEQ-2000RS FluoXpert多組學(xué)分析儀品牌:MGI(華大智造)




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04質(zhì)控與驗(yàn)證:不容忽視的細(xì)節(jié)

質(zhì)檢(樣品質(zhì)檢/文庫(kù)質(zhì)檢):

1、Qubit熒光定量?jī)x,確保核酸濃度符合建庫(kù)要求。

2、凝膠電泳:評(píng)估DNA片段的大小分布和質(zhì)量



Qubit 4(Flex) Fluorometer熒光計(jì)品牌:ThermoFisher多功能成像系統(tǒng)品牌:申花科技




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數(shù)字PCR(ddPCR)

**定量文庫(kù)濃度,避免測(cè)序失??;以及對(duì)測(cè)序結(jié)果的驗(yàn)證。



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05其他設(shè)備,小身軀大能量

離心機(jī)、混勻儀、金屬浴、磁力架、移液器等;

NGS實(shí)驗(yàn)的成功,既需要“高精尖”設(shè)備的加持,更離不開(kāi)對(duì)應(yīng)用場(chǎng)景的精準(zhǔn)匹配:

臨床診斷:優(yōu)先考慮自動(dòng)化、合規(guī)性。

科研探索:側(cè)重靈活性和技術(shù)前沿性。

成本敏感場(chǎng)景:關(guān)注國(guó)產(chǎn)替代。