TIANGEN mNGS樣本提取方案，助力精準(zhǔn)病原微生物檢測
背景：
分子診斷技術(shù)特別是病原宏基因組檢測技術(shù)（mNGS），在傳統(tǒng)病原體診斷、未知新發(fā)病原體鑒別、復(fù)合感染診斷、耐藥診斷、評估人體反應(yīng)和抗感染療效評價等方面具有良好應(yīng)用前景，為感染性疾病的防控提供了重要手段，也促進(jìn)了臨床診斷能力的提升。
mNGS可對患者樣品中的微生物和宿主遺傳物質(zhì)（DNA和RNA）進(jìn)行全面分析，并逐漸由實驗室轉(zhuǎn)移至臨床應(yīng)用，作為醫(yī)生鑒別診斷的部分依據(jù)，為客觀診斷提供支持。臨床實驗室中實施mNGS檢測，因其含有多種微生物信息，且不乏正常菌群、污染微生物及背景微生物，為*終結(jié)果的判讀帶來挑戰(zhàn)。而試劑盒中背景微生物的控制有助于背景微生物數(shù)據(jù)庫的建立，能有效助力mNGS結(jié)果的客觀判讀。
TIANGEN mNGS樣本提取方法：
TIANGEN mNGS樣本提取方案：
TANMicrobe磁珠法病原微生物DNA/RNA提取試劑盒NG550，背景核酸有效防控的小量樣本病原核酸高效提取，助力精準(zhǔn)病原微生物檢測！
實驗數(shù)據(jù)：
使用5個批次的TIANGEN病原微生物提取試劑盒（S1-S5）及3款對照試劑盒（C1-C3）提取8 ng的模擬宿主（Arachis hypogaea）基因組DNA，取1 ng 所得DNA使用TIANSeq DirectFast Library Kit（NG101）構(gòu)建測序文庫， illumina平臺Paired-End 150測序，每批試劑盒設(shè)置2個平行。所得數(shù)據(jù)經(jīng)質(zhì)控、過濾宿主序列后，進(jìn)行物種注釋。bowtie2比對病原數(shù)據(jù)庫，統(tǒng)計比對reads數(shù)量, 計算對應(yīng)RPM值。
1.有效的背景微生物核酸控制
圖1. 背景微生物核酸RPM值差異顯著性分析
計算5批次TIANGEN試劑盒提取建庫樣本（S1-S5）和3個對照試劑盒提取建庫樣本（C1-C3）中各種背景微生物RPM均值，采用非參數(shù)Wilcoxon檢驗，P-value＜0.001，呈現(xiàn)極顯著差異。結(jié)果表明TIANGEN S1-S5樣本中PRM值顯著低于對照試劑盒C1-C3。
2. 良好的產(chǎn)品穩(wěn)定性
圖2. TIANGEN S1-S5樣本常見病原微生物RPM均值Wilcoxon檢驗，采用非參數(shù)Wilcoxon檢驗，對TIANGEN S1-S5樣本數(shù)據(jù)中12種潛在背景病原微生物RPM均值的差異顯著性檢驗。結(jié)果顯示，S1-S5樣本間P-value＞0.05，無顯著差異。表明TIANGEN試劑盒在背景菌控制上表現(xiàn)出了良好的產(chǎn)品穩(wěn)定性。
圖3.常見背景病原微生物RPM均值比較
分析比較TIANGEN試劑盒所提取建庫的核酸樣本(S1-S5)和對照試劑盒所提取建庫的核酸樣本(C1-C3)中12種潛在背景病原微生物RPM均值。結(jié)果顯示,S1- S5中E. coli、 P.Aeruginosa、S. maltophilia較C1-C3組RPM均值降低。
TANMicrobe磁珠法病原微生物DNA/RNA提取試劑盒（NG550）
產(chǎn)品簡介
本試劑盒采用具有獨特分離作用的磁珠和獨特的緩沖液系統(tǒng)，從血清、血漿、淋巴液、尿液、胸腹水、肺泡灌洗液、腦脊液、唾液、拭子、組織、糞便、痰液、無細(xì)胞體液、細(xì)胞培養(yǎng)上清液或各種病毒保存液中分離純化高質(zhì)量病原微生物DNA/RNA。獨特包埋的磁珠，在一定條件下對核酸具有很強(qiáng)的親和力，而當(dāng)條件改變時，磁珠釋放吸附的核酸，能夠達(dá)到快速分離純化核酸的目的。提取的DNA/RNA得率高、純度高、質(zhì)量穩(wěn)定可靠。使用本試劑盒純化的核酸可適用于各種常規(guī)操作，包括反轉(zhuǎn)錄、PCR、RT-PCR、熒光定量PCR、NGS等各種下游實驗。
產(chǎn)品特點
樣本廣泛：適用于血漿各種體液樣本、組織懸浮液、拭子等樣本。
共提取：可同時提取病原微生物的DNA和RNA
高效快速：1 h即可完成整個流程。
高通量：可整合磁棒法自動化儀器或移液法自動化儀器進(jìn)行高通量提取實驗。
杭州沃森生物作為天根生化浙江企業(yè)代理商，為大家提供全線天根分子生物學(xué)產(chǎn)品及其他多樣化合作方式，如有需要，歡迎聯(lián)系：0571-86495259 訂購信息： 產(chǎn)品名稱 貨號 規(guī)格 TANMicrobe磁珠法病原微生物DNA/RNA提取試劑盒 NG550 100次/盒 TIANMicrobe磁珠法大體積病原微生物DNA提取試劑盒 NG530 100次/盒 其他相關(guān)產(chǎn)品：
